Die erste Kapelle wurde durch den Ammann Anton Kost um 1579 erbaut, und vom Weihbischof von Konstanz am 15 Mai 1584 „mit dem Altare“geweiht. Die Kapelle Honau erfuhr verschiedene umfassende Renovationen, so 1836, 1888 und 1930, bei denen Ausstattung und Farbgebung des Innenraumes und der Altäre verändert wurden.

1999 wurde die Kapelle Honau erneut gründlich renoviert. Man versuchte den Grundcharakter des Bauwerkes zu verfeinern und beizubehalten, wobei die Figuren in ihre frühere Fassung gebracht wurden. Auch kamen Fragmente aus alten Fresken aus der Bauzeit zum Vorschein und wurden sichtbar gemacht.